Поддержка iOS 4 позволяет с помощью iTunes сортировать приложения на домашнем экране по папкам. Помимо этого, новая версия плеера быстрее делает резервные копии данных с iPhone/iPod. Отображение обложек происходит в iTunes 9.2 еще быстрее. И кроме этого, исправлены некоторые ошибки в безопасности. Для Windows, к примеру, их было насчитано около 40 штук, и значительная часть из них была связана с браузером Safari, код которого интегрирован в плеер.