Технологии редактирования генома CRISPR невероятно точна, но когда приходится иметь дело с миллиардами пар ДНК, такая система нередко пропускает цели. Увеличить точность редактирования может добавленная к направляющей РНК небольшая структура. Речь идёт о так называемой РНК-шпильке, которая препятствует нецелевую активность работы CRISPR-системы, но не влияет на эффективность редактирования.
Такое решение проблемы предложили учёные из Университета Дьюка. Они модифицировали CRISPR-систему, добавив в конец направляющей РНК 20-нуклеотидный спейсер – зацикленный фрагмент, образующий шпильку. Фактически единственное, что может её «вскрыть», это целевая последовательность ДНК-РНК, что существенно увеличивает точность системы до одной базовой пары.
Команда учёных проверила свою методику с пятью различными вариациями CRISPR и обнаружила, что добавление структуры к направляющей РНК повышает точность редактирования в культивируемых клетках человека в среднем в 50 раз. В частности, в одном тесте этот способ оказался в 200 раз точнее, чем обычно. Тот факт, что он работает на разных CRISPR-системах, имеет решающее значение, поскольку новые версии появляются довольно регулярно. Ведь наряду с классическим белком Cas9, существуют ещё Cas12a и Cas12b, которые считаются более безопасными и точными, а также CasX и Cas3.
Источник: The New Atlas